大北农集团一直以“创建世界级农业科技企业”为企业发展愿景，在自身积极发展的同时也十分重视与国内外科研机构的合作。
　　在国内，大北农集团与科研机构与高校建立了良好的合作关系，目前已经与中国农业大学、浙江大学、东北农业大学、华中农业大学、华南农业大学等11所高等院校建立了战略合作关系，与中国农业科学院、北京市农林科学院、中国科学院微生物所等23所科研院所建立了产学研深度合作关系，主要合作方式包括委托研发及合作研发、联合人才培养、公益捐赠、共建研发机构和共同开发研究成果等。此外，大北农集团还与中国畜牧兽医学会、中国作物学会和中国植物营养与肥料学会建立了长期深入的合作关系，同时是中关村量子生物农业产业技术创新战略联盟、首都籽种产业技术创新战略联盟、首都生物饲料科技创新服务联盟、北京国际科技合作基地联盟的理事长单位，与行业内的企业、高校和科研院所共建协同创新平台，充分发挥各自的人才、技术、资金、市场和资源优势，在双方一致的目标下，制定个性化的工作机制，实现多方共赢。国际方面，与加拿大、以色列、阿根廷等多个国外机构建立了稳定的合作关系。大北农集团2011年申请并获批“北京市农业生物技术国际科技合作基地”，是北京市第一批国际科技合作基地，以生物技术育种、饲料生物技术、动物疫苗生物技术为主要领域开展国际合作，已达成多项合作。广泛的科技合作有力促进了大北农集团产业技术进步和核心竞争能力的提高，同时提升了行业竞争力，推动了我国农业发展。